This shows you the differences between two versions of the page.
Both sides previous revision Previous revision Next revision | Previous revision | ||
border_search_a_minima_hopping [2012/02/13 11:28] prokop |
border_search_a_minima_hopping [2012/02/13 11:36] (current) |
||
---|---|---|---|
Line 1: | Line 1: | ||
+ | **Vyhoda minimahopingu** | ||
Minimahoping pouziva dlouhe skoky proto je schopnen nalezt nove lokalni minimum mnohem rychleji nez metadynamika nebo border search | Minimahoping pouziva dlouhe skoky proto je schopnen nalezt nove lokalni minimum mnohem rychleji nez metadynamika nebo border search | ||
- | Problemem minimahopingu jako kazde jine monte carlo techniky je, ze stavovy prostor prochazi nesystematicky bez vyuziti pameti. Tim zbytence sampluje mnohekrat podobne konfigurace. | + | **Problemem minimahopingu** |
+ | Jako kazdy jiny Monte-Carlo techniky je, ze stavovy prostor prochazi nesystematicky bez vyuziti pameti. Tim zbytence sampluje mnohekrat podobne konfigurace. | ||
+ | **Reseni pomoci bordersearch** | ||
Bordersearch muze tento proces vyznamne zrychlit, pokud vyuzije zkonstruovanou velice hrubou mrizku (1 Angstroem) pro systematicke ukladani informace z minimahopingu tak, aby nove lokalni minima uz nenavstevoval. | Bordersearch muze tento proces vyznamne zrychlit, pokud vyuzije zkonstruovanou velice hrubou mrizku (1 Angstroem) pro systematicke ukladani informace z minimahopingu tak, aby nove lokalni minima uz nenavstevoval. | ||
Line 10: | Line 12: | ||
Bordersearch si pamatuje pro danou pozici | Bordersearch si pamatuje pro danou pozici | ||
- | Energii na pocaku relaxace (tedy pri skoku do prostred policka) | + | * Energii na pocaku relaxace (tedy pri skoku do prostred policka) |
- | Energii na konci relaxace (tedy pri opousteni policka, nebo v lokalnim minimu naleza li se v policku) | + | * Energii na konci relaxace (tedy pri opousteni policka, nebo v lokalnim minimu naleza li se v policku) |
- | Zda je lokalni minimum v policku nebo zda je v policku sousednim - ve kterem? | + | * Zda je lokalni minimum v policku nebo zda je v policku sousednim - ve kterem? - To poskytne informace o ** //Bazenech// ** |
+ | |||
+ | V prubehu relaxace do lokalniho minima je mozne prozkoumat vice policek. __V okamziku kdy relaxace zamiri do policka uz navstiveneho, je povazovano za zrelaxovano, a policko zpada do uz znameho bazenu.__ | ||
+ | |||
+ | |||
+ | **Spojitost relaxace** | ||
+ | Skoky v Boreder search by mohly zpusobit velike sily a rozleteni molekul. Proto by mely byt relaizovany v nekolika nahrubo relaxovanych mezikrocich. | ||
+ | |||
+ | |||
+ |