Nanosurf Lab

This page is read only. You can view the source, but not change it. Ask your administrator if you think this is wrong.


**Vyhoda minimahopingu**
Minimahoping pouziva dlouhe skoky proto je schopnen nalezt nove lokalni minimum mnohem rychleji nez metadynamika nebo border search

**Problemem minimahopingu**
Jako kazdy jiny Monte-Carlo techniky je, ze stavovy prostor prochazi nesystematicky bez vyuziti pameti. Tim zbytence sampluje mnohekrat podobne konfigurace.

**Reseni pomoci bordersearch** 
Bordersearch muze tento proces vyznamne zrychlit, pokud vyuzije zkonstruovanou velice hrubou mrizku (1 Angstroem) pro systematicke ukladani informace z minimahopingu tak, aby nove lokalni minima uz nenavstevoval.

Narozdil od klasickeho Border-Search, tento algoritmus dovoluje relaxovat i stupne volnosti prohledavaneho subprostoru (tedy meta-parametry) nikoli pouze ostatni geometrii. S tim suvisi nezbytnost drobne modifikace algoritmu.

Bordersearch si pamatuje pro danou pozici
   * Energii na pocaku relaxace (tedy pri skoku do prostred policka)
   * Energii na konci relaxace (tedy pri opousteni policka, nebo v lokalnim minimu naleza li se v policku)
   * Zda je lokalni minimum v policku nebo zda je v policku sousednim - ve kterem? - To poskytne informace o ** //Bazenech// **

V prubehu relaxace do lokalniho minima je mozne prozkoumat vice policek. __V okamziku kdy relaxace zamiri do policka uz navstiveneho, je povazovano za zrelaxovano, a policko zpada do uz znameho bazenu.__


**Spojitost relaxace**
Skoky v Boreder search by mohly zpusobit velike sily a rozleteni molekul. Proto by mely byt relaizovany v nekolika nahrubo relaxovanych mezikrocich.

Nanosurf Lab

User Tools

Site Tools

Page Tools