Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

@@ Line 1: / Line 1: @@
+=== Několik vylepšení minimalizace pomocí tlumené molekulární dynamiky ===
+) **Fiktivní hmotnosti** Všchny částice mají nastavené hmotnosti tak, aby jejich vibrační mody byly podobné, tzn. za předpokladu že na všechny částice působí stejná síla, mělyby by být jejich hmotnosti stejné. V opačném případě se hmotnost určuje podle maximální síly na která kdy na částici působila
+=== Minimum direction ===
+V molekulární dynamice představuje problém tlumení pomalých (mělkých) modů současně s rychlými (tuhými).
+V mírně nakloněné kruhové jámě podává většina algoritmů ( CG, BSFG, MD) špatné výsledky proto, že tvrdé mody (radiální směr) vynucují krátký časový krok, při kterém je relaxace měkých modů (pohyb údolím po odbodu) velice pomalá.
+=== Uphill Damping ===

Nanosurf Lab